Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms