Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms