Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms