Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms