Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms