Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms