Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms