Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PCSK7Q16549 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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PCSK7Q16549 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PCSK7Q16549 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PCSK7Q16549 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PCSK7Q16549 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PCSK7Q16549 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PCSK7Q16549 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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PCSK7Q16549 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCSK7Q16549 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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