Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms