Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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