Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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