Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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