Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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