Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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