Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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