Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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