Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FAM53BQ14153 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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