Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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