Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SNTB1Q13884 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SNTB1Q13884 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SNTB1Q13884 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SNTB1Q13884 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SNTB1Q13884 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB1Q13884 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms