Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
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