Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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