Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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