Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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ITGB3BPQ13352 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGB3BPQ13352 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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