Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1IP1Q13113 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms