Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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