Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms