Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR4Q05215 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR4Q05215 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR4Q05215 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR4Q05215 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR4Q05215 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms