Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU5F1Q01860 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms