Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms