Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms