Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAG1P78504 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAG1P78504 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAG1P78504 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAG1P78504 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAG1P78504 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAG1P78504 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAG1P78504 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAG1P78504 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAG1P78504 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAG1P78504 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAG1P78504 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAG1P78504 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms