Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF6P62330 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF6P62330 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF6P62330 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms