Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFM1P61960 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFM1P61960 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms