Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP107P57740 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP107P57740 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms