Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms