Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME5P56597 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME5P56597 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME5P56597 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME5P56597 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME5P56597 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME5P56597 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME5P56597 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME5P56597 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME5P56597 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME5P56597 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms