Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms