Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP2S1P53680 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms