Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK8P49336 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK8P49336 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK8P49336 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK8P49336 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms