Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU3F4P49335 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms