Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLMP48507 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLMP48507 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms