Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms