Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms