Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms