Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms