Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFNP31947 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SFNP31947 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFNP31947 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFNP31947 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFNP31947 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms