Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms