Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA5P30532 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms