Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD34P28906 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD34P28906 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD34P28906 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD34P28906 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD34P28906 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD34P28906 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD34P28906 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD34P28906 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms