Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMBRP28336 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMBRP28336 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMBRP28336 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMBRP28336 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMBRP28336 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMBRP28336 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMBRP28336 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMBRP28336 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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